1、二价和四价HPV疫苗区别主要在于预防HPV亚型不同。二价疫苗主要预防HPV16、18感染，而四价疫苗预防HPV16、18、6、11亚型感染。HPV16、18感染主要与宫颈癌和癌前病变相关，而HPV6、11亚型感染主要与尖锐湿疣相关。所以，四价疫苗不仅可预防一定程度的宫颈癌和癌前病变，还可预防尖锐湿疣的发生。
2、HPV有一两百种亚型，分高中低危型。其中高危型包括16型和18型在内共14种，宫颈癌主要是它们造成的。还有若干中低危型。HPV疫苗除了预防宫颈癌，还能预防外阴癌、阴道癌、肛门癌、口腔癌、阴茎癌等恶性肿瘤及其癌前病变，以及生殖器湿疣等皮肤病。
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